Происхождение Alopecurus × brachystylus Peterm. по данным секвенирования нового поколения (NGS)

УДК 575.17:582.52

  • А. А. Гнутиков Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н. И. Вавилова
  • Н. Н. Носов Ботанический институт им. В. Л. Комарова РАН
  • Е. О. Пунина Ботанический институт им. В. Л. Комарова РАН
  • А. В. Родионов Санкт-Петербургский госуниверситет (СПбГУ)
Ключевые слова: Гибриды, ITS, NGS, филогения Alopecurus × brachystylus, Poaceae

Аннотация

Проведено молекулярно-филогенетическое исследование гибридного вида Alopecurus × brachystylusPeterm. и некоторых предполагаемых предковых таксонов. Было использовано секвенирование нового поколения(NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК. По данным NGS-секвенированиягеном A. × brachystylus образует общие субгеномы с представителями секции Alopecurium: A. geniculatus иA. aequalis, а также с представителями типовой секции: A. pratensis, A. arundinaceus и высокогорным A. vlassowii.Кроме того, обнаружено, что A. vlassowii (секция Alopecurus) несет в своем составе последовательности, идентичные видам другой секции, Alopecurium.

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Metrics

Загрузка метрик ...

Литература

Цвелёв Н. Н. Злаки СССР. – Л.: Наука, 1976. – 788 c.

Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 26 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2017. – Vol. 66, No 6. – P. 1489. E10–E11. DOI: 10.12705/666.30

Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 27 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2018. – Vol. 67, No 5. – P. 1043. E8–E9. DOI: 10.12705/675.24

Hollingsworth P. M., Graham S. W., Little, D. P. Choosing and using a plant DNA barcode // PLoS One, 2011. – Vol. 6, Iss. 5. e19254. DOI: 10.1371/journal.pone.0019254

Kovarik A., Pires J. C., Leitch A. R., Lim K. Y., Sherwood A. M., Matyasek R., Rocca J., Soltis D. E., Soltis P. S.Rapid Concerted Evolution of Nuclear Ribosomal DNA in Two Tragopogon Allopolyploids of Recent and Recurrent Origin // Genetics, 2005. – Vol. 169, № 2. – P. 931–944. DOI: 10.1534/genetics.104.032839

Sieber V. K., Murray B. G. The cytology of the genus Alopecurus (Gramineae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1979. – Vol. 79. – P. 343–355. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1979.tb01822.x

Sieber V. K., Murray B. G. Spontaneous polyploids in marginal populations of Alopecurus bulbosus Gouan (Poaceae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1980. – Vol. 81. – P. 293–300. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1980.tb01680.x

Stace C. A., Preston C. D., Pearman, D. A. Hybrid flora of the British Isles. – Durham: BSBI Publications, 2015. – 501 p.

Wang W., Ma L., Becher H., Garcia S., Kovarikova A., Leitch I. J., Leitch A. R., Kovarik A. Astonishing 35S rDNA diversity in the gymnosperm species Cycas revoluta Thunb. // Chromosoma, 2016. – Vol. 125. – P. 683–699. DOI: 10.1007/s00412-015-0556-3
Опубликован
2020-06-01
Как цитировать
1. Гнутиков А. А., Носов Н. Н., Пунина Е. О., Родионов А. В. Происхождение Alopecurus × brachystylus Peterm. по данным секвенирования нового поколения (NGS) // проблемы ботаники южной сибири и монголии, 2020. Т. 19. № 1. С. 5-7. URL: http://journal.asu.ru/bpssm/article/view/pbssm.2020001.
Раздел
Молекулярно-генетические методы в исследовании растений и хемосистематика