Таксономическая ревизия видов рода Kailashia на основе анализа морфологических данных и молекулярной филогении
УДК 582.893.6:581.961+575.852’113
Аннотация
В статье проведено уточнение видового состава рода Kailashia с использованием молекулярно-филогенетических методов и сопоставление полученных результатов с морфологическими данными, представленными в работе (Kljuykov et al., 2022). Для молекулярно-филогенетического анализа были взяты гербарные образцы, хранящиеся в гербариях MW, HARV, KUN и NAS. В качестве маркера для молекулярных исследований были выбраны внутренние транскрибируемые спейсеры (ITS1 и ITS2) участка 18S-26S ядерной рибосомной ДНК. Описание нового вида Kailashia bouffordii по результатам ранее проведенных морфологических исследований (Kljuykov et al., 2022) согласуется с результатами реконструкции молекулярной филогении. Kailashia - это небольшой естественный род, состоящий из трех эндемичных видов (K. robusta, K. xizangensis, K. bouffordii), которые образуют в кладе «Selineae» монофилетическую группу с высокой апостериорной вероятностью.
Скачивания
Metrics
Литература
Downie S. R., Spalik K., Katz-Downie D. S., Reduron J. P. Major clades within Apiaceae subfamily Apioideae as inferred by phylogenetic analysis of nrDNA ITS sequences // Plant Diversity and Evolution, 2010. - Vol. 128, № 1 2. -P. 111-136. DOI: 10. 1127/1869-6155/2010/0128-0005
Edgar R. C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput // Nucleic Acids Research, 2004. - Vol. 32, № 5. - P. 1792-1797. DOI: 10.1093/nar/gkh340
Hall T. A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucleic Acids Symposium. - Oxford, 1999. - Vol. 41. - P. 95-98. DOI: 10.4236/sgre.2015.64007
KljuykovE. V., Lavrova T. V., Terentieva E. I., Ukrainskaja U. A., LyskovD. F. Review of the genus Kailashia (Apiaceae) with description of a new species K. bouffordii from Xizang, China // Phytotaxa, 2022. - Vol. 564, № 2. - P. 257-264. DOI: 10.11646/phytotaxa.564.2.9
Leute G. H. Untersuchungen uber den Verwandtschaftkreis der Gattung Ligusticum L. (Umbelliferae) // Teil I Annalen des Naturhistorischen Museums. - Wien, 1969. - Vol. 73. - P. 5-98.
Leute G. H. Untersuchungen uber den Verwandtschaftkreis der Gattung Ligusticum L. (Umbelliferae) // Teil II Annalen des Naturhistorischen Museums. - Wien, 1970. - Vol. 74. - P. 457-519.
Pimenov M. G., Kljuykov E. V. New West Himalayan genus of the Umbelliferae, with notes on Tibetan species, described in Pachypleurum // Feddes Repertorium, 2005. - Vol. 116, № 1-2. - P. 80-91. DOI: 10.1002/fedr.200411060
Ronquist F. R., Teslenko M., van der Mark P., Ayres D. L., Darling A., Hohna S., Larget B., Liu L., Suchard M. A., Huelsenbeck J. P. Mr. Bayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space // Systematic Biology, 2012. - Vol. 61, № 3. - P. 539-542. DOI: 10. 1093/ sysbio/ sys029
Valiejo-Roman C. M., Terentieva E. I., Samigullin T. H., Pimenov M. G. Relationships among genera in Saniculoideae (Umbelliferae) and connected taxa inferred from ITS sequences of nuclear ribosomal DNA // Taxon, 2002. - Vol. 51, № 4. - P. 685-701. DOI: 10.2307/1554966
Zhou J., Gao Y., Wei J., Liu Z. W., Downie S. R. Molecular phylogenetics of Ligusticum (Apiaceae) based on nrDNA ITS Sequences: Rampant polyphyly, placement of the Chinese endemic species, and a much-reduced circumscription of the genus // International journal of Plant Sciences, 2020. - Vol. 18, № 3. - P. 306-323 DOI: 10.1086/706851
Zhou J., Peng H., Downie S. R., Liu Z. W. A molecular phylogeny of Chinese Apiaceae subfamily Apioideae inferred from nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer sequences // Taxon, 2008. - Vol. 57, № 2. - P. 402-410. DOI: 10.2307/25066012
