Сравнительный анализ геномов шести видов Hedysarum L. (Fabaceae) с использованием метода rapidGISH

УДК 575.174.015.3:575.853:576.316.2

  • О. Ю. Юркевич ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
  • Т. Е Саматадзе ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
  • И. Ю. Селютина Центральный сибирский ботанический сад СО РАН Email: selyutina.inessa@mail.ru
  • С. И. Ромашкина ФГБНУ Всероссийский научно-исследовательский институт лекарственных и ароматических растений Email: Romashkin69@inbox.ru
  • А. Р. Семенов ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
  • С. А. Зощук ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
  • А. В. Амосова ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
  • О. В. Муравенко ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН Email: olikys@gmail.com
Ключевые слова: Хромосомный полиморфизм, GISH анализ, Hedysarum, 45S рДНК, 5S рДНК

Аннотация

Проведен сравнительный анализ геномов шести видов копеечников с использованием метода быстрой геномной гибридизации in situ (rapidGISH), который позволяет выявлять общие высокоповторяющиеся последовательности ДНК, а также показывает характер их распределения на хромосомах сравниваемых видов. На хромосомах H. alpinum, H. theinum из секции Hedysarum обнаружена дисперсная локализация геномной ДНК H. flavescens (сек. Hedysarum). На хромосомах H. neglectum из этой же секции наблюдались кластерные сигналы гибридизации ДНК H. flavescens. Локализация геномной ДНК H. alpinum выявлена на всех участках хромосом H. flavescens и H. theinum. На хромосомах H. grandiflorum и H. dahuricum из сек. Multicaulia обнаружены небольшие кластерные и дисперсные сигналы гибридизации геномной ДНК H. flavescens и H. alpinum. Полученные результаты указывают на наличие общих высокоповторяющихся последовательностей ДНК разных типов организации на хромосомах изученных видов, что свидетельствует об общности происхождения, но разной степени их родства.

Скачивания

Данные скачивания пока недоступны.

Metrics

Загрузка метрик ...

Литература

айтенов М. С. Родовой комплекс флоры // Флора Казахстана: В 2-х т. Т. 2. - Алматы: Гылым, 2001. - 280 с.

Кукушкина Т. А., Высочина Г. И., Карнаухова Н. А., Селютина И. Ю. Содержание мангиферина и суммы ксантонов в растениях некоторых дикорастущих и интродуцированных видов Hedysarum (Fabaceae) // Раст. Ресурсы, 2011. - Вып. 1. - С. 99-105.

Курбатский В. И. Hedysarum L. // Флора Сибири. Т. 9. - Новосибирск: Наука, 1994. - С. 153-165.

Amosova A. V., Bolsheva N. L., Samatadze T. E., Twardovska M. O., Zoshchuk S. A., Andreev I. O., Badaeva E. D., Kunakh V. A., Muravenko O. V. Molecular cytogenetic analysis of Deschampsia antarctica Desv. (Poaceae), Maritime Antarctic // PLoS One, 2015. - 10(9): e0138878. DOI: 10.1371/journal.pone.0138878

Arslan E., Ertugrul K., Tugay O., Dural H. Karyological studies of the genus Onobrychis Mill. and the related genera Hedysarum L. and Sartoria Boiss. and Heldr. (Fabaceae, Hedysareae) from Turkey // Caryologia, 2012. - Vol. 65, № 1. -P. 11-17. DOI: 10.1080/00087114.2012.678079

Choi B. H., Ohashi H. Generic criteria and an infrageneric system for Hedysarum and related genera (Papilionoideae-Leguminosae) // Taxon, 2003. - Vol. 52. - P. 567-576. DOI: 10.2307/3647455

Dong Y., Tang D., Zhang N., Li Y., Zhang C., Li L., Li M. Phytochemicals and biological studies of plants in genus Hedysarum // Chem. Cent. J., 2013. - 7:124. DOI: 10.1186/1752-153X-7-124

Duan L., Wen J., YangX., Liu P. L., Arslan E., Ertugrul K., ChangZ. Y. Phylogeny of Hedysarum and tribe Hedysareae (Leguminosae: Papilionoideae) inferred from sequence data of ITS, matK, trnL-F and psbA-trnH // Taxon, 2015. - Vol. 64, is. 1. - P. 49-64. DOI: http://www.jstor.org/stable/24639244

Liu P. L., Wen J., Duan L., Arslan E., Ertugrul K., Chang Z. Y. Hedysarum L. (Fabaceae: Hedysareae) is not monophyletic - Evidence from phylogenetic analyses based on five nuclear and five plastid sequences // PLoS ONE, 2017. - 12:e0170596. DOI:10.1371/journal.pone.0170596

Liu Yi., Yu-Ying Zhao, Guang-Zhong Tu, Hu-Biao Chen Flavonoids of the roots of Hedysarum kirghisorum // Biochemical Systematics and Ecology, 2005. - Vol. 33, is. 8. - P. 809-812. DOI: 10.1016/j.bse.2005.01.007

Nafisi H., Kazempour-Osaloo S., Mozaffarian V., Schneeweiss G. M. Molecular phylogeny and divergence times of the genus Hedysarum (Fabaceae) with special reference to section Multicaulia in Southwest Asia // Plant. Syst. Evol., 2019. - Vol. 305. - P. 1001-1017. DOI: 10.1007/s00606-019-01620-3

Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues// Plant Mol. Biol., 1985. - Vol. 5. - P. 69-76.

Yurkevich O. Y., Kirov I. V., Bolsheva N. L., Rachinskaya O. A., Grushetskaya Z. E., Zoschuk S. A., Samatadze T. E., Bogdanova M. V., Lemesh V. A., Amosova A. V., Muravenko O. V. Integration of physical, genetic, and cytogenetic mapping data for Cellulose synthase (CesA) genes in flax (Linum usitatissimum L.) // Front. Plant Sci., 2017. - 8:1467. DOI: 10.3389/fpls.2017.01467

Опубликован
2023-07-03
Как цитировать
Юркевич О. Ю., Саматадзе Т. Е., Селютина И. Ю., Ромашкина С. И., Семенов А. Р., Зощук С. А., Амосова А. В., Муравенко О. В. Сравнительный анализ геномов шести видов Hedysarum L. (Fabaceae) с использованием метода rapidGISH // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2023. Т. 22, № 1. С. 436-440 DOI: 10.14258/pbssm.2023084. URL: http://journal.asu.ru/bpssm/article/view/pbssm.2023084.

Наиболее читаемые статьи этого автора (авторов)