Таксономическая самостоятельность сибирского вида Elymus lenensis (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена GBSS1 (waxy)
Аннотация
В последние десятилетия проявились противоречия между таксономическими и филогенетическими моделями в систематике сосудистых растений. До настоящего времени остается множество видов, не изученных в культуре и эксперименте или известных только по гербарным образцам. Род Elymus - самый крупный в трибе Triticeae, причисленный к третичному генпулу (GP-3) по отношению к основным хлебным злакам. Тем не менее в составе рода много проблемных видов с неясным происхождением и родством. Одним из таких видов является E. lenensis, описанный из бассейна р. Лена. Показана неоднозначность описаний вида, сделанных разными авторами для Сибирского и Дальневосточного регионов. Представлены результаты анализа нуклеотидных последовательностей низкокопийного ядерного гена GBSS1 (waxy) у семи природных образцов, близких по морфологии к E. lenensis. Демонстрируется дендрограмма, построенная методом «maximum likelihood». Особенностью всех образцов, близких к E. lenensis, является присутствие только St2 клонов субгенома St, более родственных североамериканской предковой линии Pseudoroegneria spicata, чем азиатской линии, восходящей к P. strigosa (клоны субгенома St2). Общий уровень специфичности последовательностей гена GBSS1 в сравнении с реперными видами согласуется с выводом о существовании самостоятельного вида E. lenensis, особенно учитывая дистанцию между точками сбора образцов.
Скачивания
Metrics
Литература
Агафонов А. В., Асбаганов С. В., Шабанова (Кобозева) Е. В., Морозов И. В., Бондарь А. А. Геномная конституция и дифференциация субгеномов эндемичных сибирских и дальневосточных видов рода Elymus (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена waxy // Вавиловский журнал генетики и селекции, 2019. - Т. 23, № 7. -С. 817-826. DOI: 10.18699/VJ19.555
Пешкова Г. А. Elymus L. - Пырейник // Флора Сибири: Poaceae (Gramineae). - Новосибирск: Наука, 1990. -Т. 2. - С. 17-32.
Попов М. Г. Новые виды из Средней Сибири // Бот. мат. герб. Бот. инст. АН СССР, 1957а. - Т. XVIII. - C. 3-6.
Попов М. Г. Agropyrum Gaertn. - Пырей // Флора Средней Сибири. - М., Л.: Изд-во АН СССР, 1957б. - Т. 1. - С. 112-118.
Пробатова Н. С. Новые таксоны сем. Poaceae с Дальнего Востока СССР // Бот. журн., 1984. - Т. 69, № 2. - С. 251-259.
Пробатова Н. С. Мятликовые, или злаки - Poaceae Barnh. (Gramineae Juss.) // Сосудистые растения Советского Дальнего Востока. - Л.: Наука, 1985. - Т. 1. - С. 89-382.
Цвелев Н. Н. Обзор видов трибы Triticeae Dum. семейства злаков (Poaceae) во флоре СССР // Нов. сист. высш. раст., 1973. - Т. 10. - С. 19-59.
Цвелев Н. Н., Пробатова Н. С. Злаки России. - М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2019. - 646 с.
Felsenstein J. Evolutionary trees from DNA sequences: A maximum likelihood approach // J. Mol. Evol., 1981. -Vol. 17, № 6. - P. 368-376.
Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitution through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. Evol., 1980. - Vol. 16. - P. 111-120.
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol., 2018. - Vol. 35. - P. 1547-1549. DOI: 10.1093/molbev/msy096
Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M. Ugene team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit // Bioinformatics, 2012. - Vol. 28, № 8. - P. 1166-1167.
