Молекулярно-филогенетическое изучение рода Catabrosa (Poaceae): сравнительный анализ последовательностей ITS1-5.8S рДНК-ITS2 генов 35S рРНК
УДК 575.17:582.52
Аннотация
Проведен сравнительный анализ последовательностей ITS1-5.8S рДНК-ITS2 генов 35S рРНК у 20видов и морфотипов рода Catabrosa (поручейница), который до недавнего времени считался монотипным. Выявлено 7 основных гаплотипов, соответствующих отдельным видам, группам видов и некоторым морфотипам. Выдвинуты гипотезы о субгеномной композиции полиплоидных видов C. kneuckeri, C. minor, C. capusii, C. bogutensis и C. ledebourii.
Скачивания
Metrics
Литература
Ефимов С. В., Дегтярева Г. В., Терентьева Е. И. и др. Изучение полиморфизма ампликонов ITS1 и ITS2 ядерной рибосомальной ДНК с помощью высокопроизводительного параллельного секвенирования и прямого секвенирования по Сэнгеру у Paeonia lactiflora (Paeoniaceae) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2017. – № 16. – С. 246–249.
Невский С. А. Поручейница – Catabrosa P. Beauv. // Флора СССР. – Л., 1934. – Т. 2. – C. 445–446.
Родионов А. В., Амосова А. В., Беляков Е. А. и др. Генетические последствия межвидовой гибридизации, ее роль в видообразовании и фенотипическом разнообразии растений // Генетика, 2019. – Т. 55, № 3. – С. 255–272.
Цвелев Н. Н. Злаки СССР. – М.: Наука, 1976. – 788 с.
Цвелев Н. Н. Заметки о некоторых родах семейства злаков (Poaceae) // Новости сист. высш. раст., 2013. − Т. 44. – С. 26 – 38
Шнеер В. С., Пунина Е. О., Родионов А. В. Внутривидовые различия в плоидности у покрытосеменных и их таксономическая интепретация // Бот. журн., 2018. – Т. 103. – № 5. – С. 555–585.
Bor N. L. Flora Iranica: Gramineae // in Rechinger, K. H. (ed.), 1970 – 573 p.
Brysting A. K., Fay M. F., Leitch I. J., Aiken S. G. One or more species in the arctic grass genus Dupontia? – a contribution to the Panarctic Flora project // Taxon, 2004. – Т. 53. – №. 2. – С. 365–365.
Darriba D., Taboada G. L., Doallo R., Posada D. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing // Nature methods, 2012. – Т. 9. – №. 8. – С. 772.
Gillespie L. J., Soreng R. J., Bull R. D. et al. Phylogenetic relationships in subtribe Poinae (Poaceae, Poeae) based on nuclear ITS and plastid trn T–trn L–trn F sequences //Botany, 2008. – Т. 86. – №. 8. – С. 938–967.
Huelsenbeck J. P., Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees // Bioinformatics, 2001. – V. 17. – I. 8. – P. 754–755.
Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecular Biology and Evolution, 2016. – V. 33. – I. 7. – P. 1870–1874. DOI: 10.1093/molbev/msw054.
Müller K. SeqState: primer design and sequence statistics for phylogenetic DNA datasets // Appl Bioinformatics. – 2005. – V. 4. – I. 1. – P. 65–69.
Nicora E. G., Agrasar Z. R. Catabrosa P. Beauv. y Phippsia R. Brown (Gramineae) en America del Sur. // Darwiniana, 1981. – Vol. 23, № 1. – P. 179–188.
Nosov N. N., Punina E. O., Machs E. M, Rodionov A. V. Genomic composition of polyploid species in the genus Catabrosa P. Beauv. (Poaceae) as revealed by molecular phylogenetic analysis // Skvortsovia, 2017. – Vol. 4. – № 1. – P. 18 – 21.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E. Interspecific hybridization in the genus Paeonia (Paeoniaceae): polymorphic sites in transcribed spacers of the 45S rRNA genes as indicators of natural and artificial peony hybrids // Russ. J. of Genetics, 2012. – V. 48, № 7. – С. 684–697.
Punina E. O., Machs E. M., Krapivskaya E. E., Rodionov A. V. Polymorphic sites in transcribed spacers of 35s rRNA genes as an indicator of origin of the Paeonia cultivars // Russ. J. of Genetics., 2017. – V. 53, № 2. – С. 202–212.
Punina E. O., Nosov N. N., Myakoshina Y. A. et al. New octoploid Catabrosa (Poaceae) species from Altai // Kew Bulletin, 2016. – V. 71. – № 3:35. DOI 10.1007/S12225-016-9646-5
Rodionov A. V., Dobryakova K. S., Punina E. O. Polymorphic sites in ITS1-5.8S rDNA-ITS2 region in hybridogenic genus × Elyhordeum and putative interspecific hybrids Elymus (Poaceae: Triticeae) // Russ. J. of Genetics, 2018. –V. 54, № 9. – С. 1025–1039.
Soreng R. J., Fish L. Catabrosa versus Colpodium (Poaceae: Poeae) in southern Africa, with a key to these genera and their species in Africa // Kew. Bull., 2011. – Vol. 66, № 1. – P. 101 – 110.
Soreng R. J. Peterson P. M., Romaschenko K. et al. A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) //Journal of Systematics and Evolution, 2015. – Т. 53. – №. 2. – С. 117–137.
Soreng R. J. Peterson P. M., Romaschenko K. et al. A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) II: An update and a comparison of two 2015 classifications //Journal of Systematics and Evolution, 2017. – Т. 55. – №. 4. – С. 259–290.
