Геномная конституция диплоидных видов рода Avena L. с A-геномом по данным секвенирования следующего поколения (NGS)
УДК 575.17:582.52
Ключевые слова:
А-геном, овес, филогения, NGS, Poaceae
Аннотация
Для диплоидных (2x) видов с A-геномом, а также для гексаплоида (6x) из рода Avena было проведено локус-специфичное секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательностирайона внутреннего транскрибируемого спейсера ITS1 и начала гена 5.8S рРНК. Показано высокое разнообразиеи разнородность геномов диплоидных видов. Выявлено, что геномы современных диплоидных видов овсов относительно далеко отстоят от гексаплоидных видов. Обнаружено, что A. canariensis занимает обособленное положение среди остальных диплоидных видов, а также принимает лишь незначительное участие в формированиигеномов гексаплоидов.
Скачивания
Данные скачивания пока недоступны.
Metrics
Загрузка метрик ...
Литература
Камелин Р. В. Особенности видообразования у цветковых растений // Труды Зоологического института РАН, 2009. – Приложение № 1. – С. 141–149.
Лоскутов И. Г. Овес (Avena L.). Распространение, систематика, эволюция и селекционная ценность. – СПб.: ГНЦ РФ ВИР, 2007. – 336 с.
Лоскутов И. Г. Межвидовые скрещивания в роде Avena L. // Генетика, 2001. – Т. 37. – C. 581-590.
Родионов А. В., Гнутиков A. А., Коцинян А. Р., Коцеруба В. В., Носов Н. Н., Пунина Е. О., Райко М. П., Тюпа Н. Б., Ким Е. С. Последовательность ITS1–5.8S рДНК–ITS2 в генах 35S рРНК как маркер при реконструкции филогении злаков (сем. Poaceae) // Уcпехи современной биологии, 2016. – Т. 136, № 5. – С. 419–438.
Baum B. R. Oats: wild and cultivated. A monograph of the genus Avena L. (Poaceae). – Canada. monogr., 1977. – 463 pp.
Clement M., Posada D., Crandall K. A. TCS: a computer program to estimate gene genealogies // Molecular Ecology, 2000. – Vol. 9, № 10. – P. 1657–1660. DOI:10.1046/j.1365-294x.2000.01020.x
Ladizinsky G. Studies in Oats Evolution. – Heidelberg e.a.: Springer, 2012. – 87 p.
Loskutov I. G., Rines H. W. Avena L. In: Kole C. (ed) Wild crop relatives: genomic and breeding resources. –Heidelberg: Springer, 2011. – P. 109–184.
Múrias dos Santos A., Cabezas M. P., Tavares A. I., Xavier R., Branco M. TCS BU: A tool to extend TCS network layout and visualization // Bioinformatics, 2016. – Vol. 32, № 4. – P. 627–628. DOI:10.1093/bioinformatics/btv636
Лоскутов И. Г. Овес (Avena L.). Распространение, систематика, эволюция и селекционная ценность. – СПб.: ГНЦ РФ ВИР, 2007. – 336 с.
Лоскутов И. Г. Межвидовые скрещивания в роде Avena L. // Генетика, 2001. – Т. 37. – C. 581-590.
Родионов А. В., Гнутиков A. А., Коцинян А. Р., Коцеруба В. В., Носов Н. Н., Пунина Е. О., Райко М. П., Тюпа Н. Б., Ким Е. С. Последовательность ITS1–5.8S рДНК–ITS2 в генах 35S рРНК как маркер при реконструкции филогении злаков (сем. Poaceae) // Уcпехи современной биологии, 2016. – Т. 136, № 5. – С. 419–438.
Baum B. R. Oats: wild and cultivated. A monograph of the genus Avena L. (Poaceae). – Canada. monogr., 1977. – 463 pp.
Clement M., Posada D., Crandall K. A. TCS: a computer program to estimate gene genealogies // Molecular Ecology, 2000. – Vol. 9, № 10. – P. 1657–1660. DOI:10.1046/j.1365-294x.2000.01020.x
Ladizinsky G. Studies in Oats Evolution. – Heidelberg e.a.: Springer, 2012. – 87 p.
Loskutov I. G., Rines H. W. Avena L. In: Kole C. (ed) Wild crop relatives: genomic and breeding resources. –Heidelberg: Springer, 2011. – P. 109–184.
Múrias dos Santos A., Cabezas M. P., Tavares A. I., Xavier R., Branco M. TCS BU: A tool to extend TCS network layout and visualization // Bioinformatics, 2016. – Vol. 32, № 4. – P. 627–628. DOI:10.1093/bioinformatics/btv636
Опубликован
2021-09-20
Как цитировать
Носов Н. Н., Гнутиков А. А., Лоскутов И. Г., Блинова Е. В., Родионов А. В. Геномная конституция диплоидных видов рода Avena L. с A-геномом по данным секвенирования следующего поколения (NGS) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2021. Т. 20, № 1. С. 333-335 DOI: 10.14258/pbssm.2021066. URL: http://journal.asu.ru/bpssm/article/view/pbssm.2021066.
Раздел
Статьи
