Содержание ядерной ДНК в некоторых сортах растений, используемых в качестве внешних стандартов в проточной цитометрии

  • M. V. Skaptsov Южно-Сибирский ботанический сад, Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • S. V. Smirnov Южно-Сибирский ботанический сад, Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия
  • M. G. Kutsev Южно-Сибирский ботанический сад, Алтайский государственный университет, Барнаул, Россия

Аннотация

Целью исследований стало опреде- ление содержания ДНК и размера генома некоторых сортов культурных растений для использования их в последующем в качестве внешнего стандарта в проточной цитометрии растений. Основной задачей являлся поиск широко распространенных сортов культурных растений, позволяющих исследовать большинство растительных объектов с содержанием ДНК в диапазоне от 0,1 до 60 пг. Кроме того, в работе были проанализированы и сопоставлены данные из международных баз данных с фактическим содержанием ДНК отечественных сортов растений. Также приведены рекомендации для оптимизации методики проведения эксперимента и интерпретации данных. В результате работы установлено несколько сортов растений, наиболее удобных для использования в качестве внешнего стандарта. Сорта родов Lepidium, Sinapis, Petroselinum, Pisum, Lathyrus и Vicia отличаются высокими показателями изоляции ядер, большим количеством изолированных ядер, а также низким количеством разрушенных ядер, а соответственно, низким уровнем фоновой флюоресценции, что немаловажно для проведения эксперимента.

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Литература

Bennett M.D., Leitch I.J. Plant DNA C-values database (release 6.0, Dec. 2012) [Electronic resource] // Royal botanical garden KEW [Official website]. URL: http://www.kew.org/cvalues/ (accessed: 12 V 2014)

Doležel J., Bartoš J., Voglmayr H., Greilhuber J. Nuclear dna content and genome size of trout and human // Cytometry, 2003. – Vol. 51. – P. 127–128. DOI: 10.1002/cyto.a.10013

Doležel J., Doleželova M., Novak F.J. Flow cytometric estimation of nuclear DNA amount in diploid bananas (Musa acuminata and M. balbisiana) // Biologia Plantarum, 1994. – Vol. 36, No. 351 – P. 357. DOI: 10.1007/BF02920930

Doležel J., Greilhuber J., Lucretti S., Meister A., Lysak M., Nardi L., Obermayer R. Plant genome size estimation by flow cytometry: inter-laboratory comparison // Annals of Botany, 1998. – Vol. 82. – Suppl. A. – P. 17–26.

Doležel J., Greilhuber J., Suda J. Estimation of nuclear DNA content in plants using flow cytometry // Nature Protoc., 2007. – Vol. 2. – P. 2233–2244. DOI: 10.1038/nprot.2007.310

Doležel J., Sgorbati S., Lucretti S. Comparison of three DNA fluorochromes for flow cytometric estimation of nuclear DNA content in plants // Physiologia Plantarum, 1992. – Vol. 85. – P. 625–631. DOI: 10.1111/j.1399-3054.1992.tb04764.x

Greilhuber J., Ebert I. Genome size variation in Pisum sativum // Genome, 1994. – Vol. 37, No. 4. – P. 646–655. DOI: 10.1139/g94-092

Jiao Y.,Wickett N., Ayyampalayam S., Chanderbali A., Landherr L., Ralph P., Tomsho L., Hu Y., Liang H., Soltis P., Soltis D., Clifton S., Schlarbaum S., Schuster S., Ma H., Leebens-Mack J., dePamphilis C. Ancestral polyploidy in seed plants and angiosperms // Nature, 2011. – Vol. 473. – P. 97–100. DOI: 10.1038/nature09916

Kubešová M., Moravcová L., Suda J., Jarošík V., Pyšek P. Naturalized plants have smaller genomes than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora // Preslia, 2010. – Vol. 82. – P. 81–96.

Marie D, Brown S.C. A cytometric exercise in plant DNA histograms, with 2C values for 70 species // Biology of the Cell, 1993. – Vol. 78. – P. 41–51. DOI: 10.1016/0248-4900(93)90113-S

Matzk F., Meister A., Schubert I. An efficient screen for reproductive pathways using mature seeds of monocots and dicots // The Plant Journal, 2000. – Vol. 21, No. 1. – P. 97–108. DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00647.x

Otto F. DAPI staining of fixed cells for high-resolution flowcytometry of nuclear DNA // Methods in cell biology / Ed. by H.A. Crissman, Z. Darzynkiewicz. – New York: Academic Press, 1990. – Vol. 33. – P. 105–110.

Pfosser M., Amon A., Lelley T., Heberle-Bors E. Evaluation of sensitivity of flow cytometry in detecting aneuploidy in wheat using disomic and ditelosomic wheat-rye addition lines // Cytometry, 1995. – Vol. 21, № 4. – P. 387–393. DOI: 10.1002/cyto.990210412

Salameh N.M. Flow cytometric analysis of nuclear DNA between okra landraces (Abelmoschus esculentus L.) // American Journal of Agricultural and Biological Sciences, 2014. – Vol. 9, № 2. – P. 245–250. DOI: 10.3844/ajabssp.2014.245.250

Sammour R.H. Genetic diversity and allele mining in soybean germplasm // Soybean – genetics and novel techniques for yield enhancement / Ed. by D. Krezhova. – Rijeka: InTech, 2007. – P. 1–21. DOI: 10.5772/727

Tiersch T.R., Chandler R.W., Wachtel S.S.M, Ellias S. Reference standards for flow cytometry and application in comparative studies of nuclear DNA content // Cytometry, 1989. – Vol. 10. – P. 706–710. DOI: 10.1002/cyto.990100606

Wolf D.E., Steets J.A., Houliston G.J., Takebayashi N. Genome size variation and evolution in allotetraploid Arabidopsis kamchatica and its parents, A. lyrata and A. halleri [Electronic resource] // AoB PLANTS [Official website]. URL: http://aobpla.oxfordjournals.org/content/6/plu025 (26 V 2014) DOI: 10.1093/aobpla/plu025

Как цитировать
Skaptsov, M. V., Smirnov, S. V., & Kutsev, M. G. (1). Содержание ядерной ДНК в некоторых сортах растений, используемых в качестве внешних стандартов в проточной цитометрии. Turczaninowia, 17(3), 72–78. https://doi.org/10.14258/turczaninowia.17.3.8
Раздел
Научные статьи