Идентификация видов Lamiaceae флоры Узбекистана с использованием ДНК-маркеров
УДК 582.949.2+577.21(575.1)
Аннотация
Флора Узбекистана характеризуется высоким разнообразием яснотковых и насчитывает около 240 видов, принадлежащих 40 родам. 30 видов семейства Lamiaceae занесены в Красную книгу Узбекистана. Редкие виды требуют регулярного мониторинга и всестороннего изучения как классическими методами, так и методами молекулярно-генетического анализа. Данные исследования направлены на изучение видового разнообразия флоры Узбекистана с использованием ДНК-маркеров. Материалом для исследований служили виды семейства Lamiaceae, произрастающие на территории Узбекистана. Видовая идентификация выполнена по двух-четы-рехлокусным комбинациям ДНК маркеров (ITS, rbcL, trnL-trnF, matK, psbA-trnH). Полученные 76 консенсусных нуклеотидных последовательностей ITS региона использовано для молекулярно-филогенетического анализа семейства. Представлены филогенетические взаимоотношения 26 родов, сгруппированных в четыре подсемейства: Nepetoideae, Lamioideae, Scutellarioideae, Ajugoideae, на основании нуклеотидной вариабельности.
Скачивания
Metrics
Литература
Тожибаев К. Ш., Бешко Н. Ю., Попов В. А. Ботанико-географическое районирование Узбекистана // Бот. журн., 2016. - Т. 101, № 10. - С. 1105-1132.
Darriba D., Taboada G., Doallo R., Posada D. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing // Nat. Methods, 2012. - Vol. 9. - P. 772.
GenBank. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov (accessed 14.09.2023).
Harley R. M., Atkins S., Budantsev A. L. et al. Flowering plants dicotyledons: Lamiales (except Acanthaceae including Avicenniaceae) // The Families and Genera of Vascular Plants / J. W. Kadereit (ed.). - Berlin, Heidelberg: Springer, 2004. -Vol. 6. - P. 167-275. DOI: 10.1007/978-3-642-18617-2_11
Huelsenbeck J.P., Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees // Bioinformatics, 2001. - Vol. 17, No. 8. - P. 754-755. DOI: 10.1093/bioinformatics/17.8.754
The Plant List. URL: http://www.theplantlist.org/1.1/browse/A/Lamiaceae/ (accessed 13.09.2023).
Juramurodov I., Tojibaev K. Sh., Nikitina E. V. et al. Hedysarum sunhangii (Fabaceae, Hedysareae), a new species from Pamir-Alay (Babatag Ridge - Uzbekistan) // Phytotaxa, 2021. - Vol. 524, No. 1. - P. 1-13.
Kress J., Wurdack K., Zimmer E., Lee W., Janzen D. Use of DNA barcodes to identify flowering plants // PNAS, 2005. -Vol. 102, No. 23. - P. 8369-8374. DOI: 10.1073/pnas.0503123102
Nikitina E. V., Beshko N. Yu., Omarov S. A. Assessment of plant species diversity (Lamiaceae Lindle.) in Uzbekistan based on DNA barcoding // IOP Conf. Series: Earth and Environmental Science, 2022. - Vol. 1068, No. 012042. DOI: 10.1088/1755-1315/1068/1/012042
Rambaut A. FigTree v1. 4.0. - University of Oxford, Oxford, UK. 2012. URL: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree. Sennikov A. N., Tojibaev K. Sh., Khassanov F. O., Beshko N. Yu. The Flora of Uzbekistan Project // Phytotaxa, 2016. -Vol. 282, No. 2. - P. 107-118.
Shchegoleva N. V., Nikitina E. V., Juramurodov I. J. et al. A new species of Ranunculus (Ranunculaceae) from Western Pamir-Alay, Uzbekistan // PhytoKeys, 2022. - Vol. 193. - P. 125-139. DOI: 10.3897/phytokeys.193.70757
Tojibaev K. Sh. Monitoring of the Relic Endemics of Uzbekistan’s Flora // Czech J. Genet Plant Breed, 2010. - Vol. 46. -P. 45-46.
