Происхождение Alopecurus × brachystylus Peterm. по данным секвенирования нового поколения (NGS)
УДК 575.17:582.52
Ключевые слова:
Гибриды, ITS, NGS, филогения Alopecurus × brachystylus, Poaceae
Аннотация
Проведено молекулярно-филогенетическое исследование гибридного вида Alopecurus × brachystylusPeterm. и некоторых предполагаемых предковых таксонов. Было использовано секвенирование нового поколения(NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК. По данным NGS-секвенированиягеном A. × brachystylus образует общие субгеномы с представителями секции Alopecurium: A. geniculatus иA. aequalis, а также с представителями типовой секции: A. pratensis, A. arundinaceus и высокогорным A. vlassowii.Кроме того, обнаружено, что A. vlassowii (секция Alopecurus) несет в своем составе последовательности, идентичные видам другой секции, Alopecurium.
Скачивания
Metrics
PDF views
140
Литература
Цвелёв Н. Н. Злаки СССР. – Л.: Наука, 1976. – 788 c.
Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 26 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2017. – Vol. 66, No 6. – P. 1489. E10–E11. DOI: 10.12705/666.30
Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 27 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2018. – Vol. 67, No 5. – P. 1043. E8–E9. DOI: 10.12705/675.24
Hollingsworth P. M., Graham S. W., Little, D. P. Choosing and using a plant DNA barcode // PLoS One, 2011. – Vol. 6, Iss. 5. e19254. DOI: 10.1371/journal.pone.0019254
Kovarik A., Pires J. C., Leitch A. R., Lim K. Y., Sherwood A. M., Matyasek R., Rocca J., Soltis D. E., Soltis P. S.Rapid Concerted Evolution of Nuclear Ribosomal DNA in Two Tragopogon Allopolyploids of Recent and Recurrent Origin // Genetics, 2005. – Vol. 169, № 2. – P. 931–944. DOI: 10.1534/genetics.104.032839
Sieber V. K., Murray B. G. The cytology of the genus Alopecurus (Gramineae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1979. – Vol. 79. – P. 343–355. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1979.tb01822.x
Sieber V. K., Murray B. G. Spontaneous polyploids in marginal populations of Alopecurus bulbosus Gouan (Poaceae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1980. – Vol. 81. – P. 293–300. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1980.tb01680.x
Stace C. A., Preston C. D., Pearman, D. A. Hybrid flora of the British Isles. – Durham: BSBI Publications, 2015. – 501 p.
Wang W., Ma L., Becher H., Garcia S., Kovarikova A., Leitch I. J., Leitch A. R., Kovarik A. Astonishing 35S rDNA diversity in the gymnosperm species Cycas revoluta Thunb. // Chromosoma, 2016. – Vol. 125. – P. 683–699. DOI: 10.1007/s00412-015-0556-3
Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 26 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2017. – Vol. 66, No 6. – P. 1489. E10–E11. DOI: 10.12705/666.30
Gnutikov A. A., Punina E. O., Nosov N. N., Rodionov A. V. In: IAPT/IOPB chromosome data 27 (K. Marhold & J.Kučera, eds.) // Taxon, 2018. – Vol. 67, No 5. – P. 1043. E8–E9. DOI: 10.12705/675.24
Hollingsworth P. M., Graham S. W., Little, D. P. Choosing and using a plant DNA barcode // PLoS One, 2011. – Vol. 6, Iss. 5. e19254. DOI: 10.1371/journal.pone.0019254
Kovarik A., Pires J. C., Leitch A. R., Lim K. Y., Sherwood A. M., Matyasek R., Rocca J., Soltis D. E., Soltis P. S.Rapid Concerted Evolution of Nuclear Ribosomal DNA in Two Tragopogon Allopolyploids of Recent and Recurrent Origin // Genetics, 2005. – Vol. 169, № 2. – P. 931–944. DOI: 10.1534/genetics.104.032839
Sieber V. K., Murray B. G. The cytology of the genus Alopecurus (Gramineae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1979. – Vol. 79. – P. 343–355. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1979.tb01822.x
Sieber V. K., Murray B. G. Spontaneous polyploids in marginal populations of Alopecurus bulbosus Gouan (Poaceae) // Botanical Journal of the Linnaean Society, 1980. – Vol. 81. – P. 293–300. DOI: 10.1111/j.1095-8339.1980.tb01680.x
Stace C. A., Preston C. D., Pearman, D. A. Hybrid flora of the British Isles. – Durham: BSBI Publications, 2015. – 501 p.
Wang W., Ma L., Becher H., Garcia S., Kovarikova A., Leitch I. J., Leitch A. R., Kovarik A. Astonishing 35S rDNA diversity in the gymnosperm species Cycas revoluta Thunb. // Chromosoma, 2016. – Vol. 125. – P. 683–699. DOI: 10.1007/s00412-015-0556-3
Опубликован
2020-06-01
Как цитировать
Гнутиков А. А., Носов Н. Н., Пунина Е. О., Родионов А. В. Происхождение Alopecurus × brachystylus Peterm. по данным секвенирования нового поколения (NGS) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2020. Т. 19, № 1. С. 5-7 DOI: 10.14258/pbssm.2020001. URL: https://journal.asu.ru/bpssm/article/view/pbssm.2020001.
Раздел
Молекулярно-генетические методы в исследовании растений и хемосистематика
