Молекулярно-генетический анализ видов семейства Lamiaceae в Узбекистане с использованием ДНК маркеров
УДК 582.949.2+502.3+575.113.1(575.1)
Аннотация
Редкие и исчезающие виды растений особенно чувствительно реагируют на климатические изменения и деструктивные антропогенные воздействия. В последнее издание Красной книги Узбекистана включены 314 видов растений, что составляет около 7 % флоры Узбекистана, из них 30 видов относятся к семейству Lamiaceae. Данная работа посвящена исследованию видового разнообразия редких видов семейства Lamiaceae флоры Узбекистана с использованием комбинаций ДНК-маркеров. Проанализированы пластидные и ядерные маркерные последовательности ITS, rbcL, trnL-trnF, matK у некоторых редких видов семейства Lamiaceae. Филогенетически информативным оказалось совместное использование двух молекулярных маркеров ITS+trnL-trnF, с помощью которых было подтверждено деление семейства Lamiaceae на два кластера Lamioideae + Scutellarioideae и Nepetoideae. Распределение видов в пределах кластеров согласовалось с эколого-морфологической классификацией семейства. Полиморфизм хлоропластного региона trnL-trnF у семи представителей рода Lagochilus позволил дифференцировать близкородственные виды этого рода. Использование 4-х локусной ДНК панели дало возможность провести маркирование редкого вида Lagochilus olgae.
Скачивания
Metrics
Литература
Буданцев А. Л. Систематика рода Dracocephalum L. (Lamiaceae) // Бот. журн., 1987. - Т. 72, № 2. - C. 260-267.
Красная книга Узбекистана. Растения. - Ташкент: Чинор ENK, 2019. - 360 с.
Никитина Е. В., Тожибаев К. Ш., Савина Н. В., Кубрак С. В., Кильчевский А. В. Экологический мониторинг редких видов рода Salvia (Lamiaceae) Узбекистана с использованием ДНК-штрихкодирования // Актуальные проблемы изучения и сохранения фито- и микобиоты. - Минск, 2021. - С. 146-150.
Тожибаев К. Ш., Бешко Н. Ю., Попов В. А. Ботанико-географическое районирование Узбекистана // Бот. журн., 2016. - Т. 101, № 10. - С. 1105-1132.
Brummitt N., Araujo A. C., Harris T. Areas of plant diversity - What do we know? // Plants People Planet, 2021. -Vol. 3, No 1. - P. 33-44. D0I:10.1002/ppp3.10110
Convention on biological diversity, 1992. - UN. - 28 p. URL: https://www.cbd.int/convention (Accessed on 01.02.2024).
Darriba D., Taboada G., Doallo R., Posada D. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing // Nat. Methods, 2012. - Vol. 9. - 772 pp.
Drew B. T., Sytsma K. J. Phylogenetics, biogeography, and staminal evolution in the tribe Mentheae (Lamiaceae) // Am. J. Bot., 2012. - Vol. 99. - P. 933-953.
Global Biodiversity Information Facility. URL: www.gbif.org (Accessed on 01.02.2024).
Huelsenbeck J. P., Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees // Bioinformatics, 2001. - Vol. 17, No 8. - P. 754-755. DOI: 10.1093/bioinformatics/17.8.754
IUCN Red List of Threatened Species. Version 2021-3. URL: https://www.iucnredlist.org (Accessed on 20.02.2024).
Khojimatov О. Medical plants of Uzbekistan: their past, present and future // Foods & Food Ingredients J. Jpn., 2019. -Vol. 224, No 2. - P. 201-207.
Mamadalieva N. Z., Akramov D. K., Ovidi E., Tiezzi A. et. al. Aromatic Medicinal Plants of the Lamiaceae Family from Uzbekistan: Ethnopharmacology, Essential Oils Composition, and Biological Activities // Medicines, 2017. - Vol. 4, No 1. - 8 p. DOI: 10.3390/medicines4010008
National Center for Biotechnology Information. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov (Accessed on 01.02.2024).
Nikitina E., Rakhmatov A. Identification of Nepeta olgae Regel and phylogenetic status of some genera in subtribe Nepetinae (Lamiaceae) using DNA markers // BIO Web of Conferences, 2021. - Vol. 38. DOI: 10.1051/bioconf/20213800087
Rambaut A. FigTree v1. 4.0. - Oxford, UK: University of Oxford, 2012. URL: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
Sennikov A. N., Lazkov G. A. Taxonomic corrections and new records in vascular plants of Kyrgyzstan // Memoranda Soc. Fauna Flora Fennica, 2013. - Vol. 891. - P. 125-138.
Sennikov A. N., Tojibaev K. Sh., Khassanov F. O., Beshko N. Yu. The Flora of Uzbekistan Project // Phytotaxa, 2016. -Vol. 282, № 2. - P. 107-118.
Zhao F., Chen Y. P., Salmaki Y., Drew B. T. et. al. An updated tribal classification of Lamiaceae based on plastome phylogenomics // B. M. C. Biol., 2021. - Vol. 19, No 2. DOI: 10.1186/s12915-020-00931-z
