Использование внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) и фактора элонгации трансляции (tef1a) для идентификации видов рода Trichoderma
УДК 575.2
Аннотация
Виды рода Trichoderma имеют высокое прикладное значение, продуцируют ферменты (целлюлазы, ксиланазы), антибиотики и стимуляторы роста растений. Генетические исследования помогают отбирать новые штаммы и изоляты для практического использования. Молекулярно-генетические исследования видов Trichoderma приобретают всё большую актуальность в связи с их биотехнологическим потенциалом, экологической значимостью и сложностями традиционной идентификации. Виды Trichoderma обладают высокой морфологической пластичностью, что затрудняет их дифференциацию по микроскопическим и культуральным признакам. Стандартным для идентификации видов является регион ITS (внутренний транскрибируемый спейсер), но для Trichoderma он часто недостаточен из-за высокой консервативности. Некоторые виды имеют идентичные ITS-последовательности, что требует дополнительных генетических маркеров. Целью работы является сравнение ITS и фактора элонгации трансляции (tef1a) для идентификации видов рода Trichoderma. В результате анализа видовая принадлежность видов была подтверждена с высокой точностью. Маркеры ITS и tef1a могут быть использованы как по отдельности, так и совместно для идентификации видов рода, контроля загрязнений в коллекциях и чистоты маточных культур на биотехнологических производствах.
Скачивания
Литература
Jaklitsch W. M., Komon M., Kubicek C. P., Druzhinina I. S. Hypocrea crystalligena sp. nov., a common European species with a white-spored Trichoderma anamorph // Mycologia, 2006. – Vol. 98. – Pp. 499–513.
Kubiak A., Wolna-Maruwka A., Pilarska A. A., Niewiadomska A., Piotrowska-Cyplik A. Fungi of the Trichoderma Genus: Future Perspectives of Benefits in Sustainable Agriculture // Applied Sciences, 2023. – Vol. 13, № 11. – P. 6434. https://doi.org/10.3390/app13116434
Pozo M. J., Herrero B., Martín-García J., Santamaría O., Poveda J. Evaluating potential side effects of Trichoderma as biocontrol agent: A two-edged sword? // Current Opinion in Environmental Science & Health, 2024. – Vol. 41. – P. 100566. https://doi.org/10.1016/j.coesh.2024.100566
Rahimi M. J., Cai F., Grujic M., Chenthamara K., Druzhinina I. S. Molecular Identification of Trichoderma reesei // Methods in Molecular Biology, 2021. – Vol. 2234. – Pp. 167–183. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1048-0_14
Sánchez-García B., Espinosa E., Villordo-Pineda E., Rodriguez Guerra R., Mora-Avilés M. Trichoderma spp. native strains molecular identification and in vitro antagonistic evaluation of root phytopathogenic fungus of the common bean (Phaseolus vulgaris L.) cv. montcalm // Agrociencia, 2017. – Vol. 51. – Pp. 63–79.
Shah M. M., Afiya H. Introductory Chapter: Identification and Isolation of Trichoderma spp. – Their Significance in Agriculture, Human Health, Industrial and Environmental Application: IntechOpen. – London, 2019. – 116 p. https://doi.org/10.5772/intechopen.83528
Skaptsov M. V., Kutsev M. G., Smirnov S. V. et al. The potential use of hyperparasitic Tuberculina persicina and Fusarium sambucinum for biocontrol of Puccinia sp. // Ukrainian Journal of Ecology, 2018a. – Vol. 8, № 4. – Pp. 264–265.
Skaptsov M., Smirnov S., Kutsev M. et al. Pathogenicity of Simplicillium lanosoniveum to Coccus hesperidum // Ukrainian Journal of Ecology, 2017. – Vol. 7, № 4. – Pp. 689–691. https://doi.org/10.15421/2017_1801
Skaptsov M., Smirnov S., Kutsev M., Matsyura A. Antifungal activity of several isolates of Trichoderma against Cladosporium and Botrytis // Ukrainian Journal of Ecology, 2018b. – Vol. 8, № 1. – Pp. 88–91. https://doi.org/10.15421/2018_191
