Identification of collection samples of the genus Spiraea L. (Rosaceae) of the Botanical garden of the Institute of Biology of Komi SC UrB RAS according molecular data

УДК 582.639.3:575:061:62:58(470.13)

  • A. N. Smirnova Email: smirnova@ib.komisc.ru
  • K. S. Zainullina Institute of Biology of Komi SC UrB RAS, Syktyvkar, Russia Email: smirnova@ib.komisc.ru
Keywords: Botanical garden, identification, ITS-region, nucleotide sequence, rDNA, Spiraea, taxonomy

Abstract

The genus Spiraea L. of the subfamily Spiraeoideae of the Rosaceae family is taxonomically complex. Weconducted molecular genetic studies to identify taxa of the genus. The ITS sequences of ribosomal DNA of 21 Spiraeasamples including one wild sample of the local species of Spiraea media are obtained. Some of these ITS fragments werefirst sequenced.

Downloads

Download data is not yet available.

Metrics

Metrics Loading ...

References

Бонюк З. Г. Таволги (Spiraea L.). – Киев: ВПЦ Киівский університет, 2008. – 248 с.

Мамаев С. А., Семкина Л. А. Интродуцированные деревья и кустарники Урала (розоцветные). -Свердловск: АН СССР, УО, 1988. – 105 с

Полякова Т. А., Шатохина А.В., Ширманов М.В., Бондаренко Г.Н. Оценка таксономических отношений у сибирских представителей секции Chamaedryon Ser. рода Spiraea L. (Rosaceae Juss.) на основе анализа нуклеотидного полиморфизма ITS–региона // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии : сб. науч. ст. по материалам Четырнадцатой междунар. науч.-практ. конф. (Барнаул, 25–29 мая 2015 г.). – Барнаул: Изд–во АлтГУ, 2015. – С. 353–358.

Шульгина В. В. Род Таволга – Spiraea L. // Деревья и кустарники СССР. – Т. 3. – М.–Л., 1954. – С. 286–332

BLAST: Basic local alignment search tool, 2018 URL: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (Дата обращения 02.12.2018)

GenBank Home, 2018. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/. (Дата обращения 14.01.2019)

Huh M. K., Huh H. W., Lee S. Y. A taxonomic study of the genus Spiraea in Korea using sequences of ITS // Journal of Life Science, 2008. – Vol. 18. – № 5. – P. 694–700.

Huh M. K. Analysis of the phylogenetic relationships in the genus Spiraea based on the nuclear ribosomal DNA ITS region // Journal of Life Science, 2012. – № 22. – P. 285–292

Potter D., Still S. M., Grebenc T., Ballian D., Bozic G., Franjiae J., Kraigher H. Phylogenetic relationships in tribe Spiraeae (Rosaceae) inferred from nucleotide sequence data // Plant Syst. Evol., 2007. – № 266 (1-2). – P. 105–118.

Zhang Z., Fan L., Yang J., Hao X., Gu Z. Alkaloid polymorphism and ITS sequence variation in the Spiraea japonica complex (Rosaceae) in China: traces of the biological effects of the Himalaya–Tibet Plateau uplift. // Am. J. Bot., 2006. – № 93 (5). – P. 762–769.

Published
2019-06-17
How to Cite
Smirnova A. N., Zainullina K. S. Identification of collection samples of the genus Spiraea L. (Rosaceae) of the Botanical garden of the Institute of Biology of Komi SC UrB RAS according molecular data // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2019. Vol. 18, № 1. P. 72-74 DOI: 10.14258/pbssm.2019013. URL: https://journal.asu.ru/bpssm/article/view/pbssm.2019013.
Section
Molecular methods in the study of plants and chemosystematics