Ключевые слова
генетическое разнообразие
ДНК-маркеры
микросателлитные локусы
урожайность
продуктивность
Как цитировать
Аннотация
В данном исследовании были изучены связи между длинами микросателлитных локусов и проявлением ключевых сельскохозяйственных характеристик у дикой сои (Glycine soja). Объектом анализа послужили 46 коллекционных форм данной культуры, собранные из различных районов Амурской области, а также 2 формы из Китая, 1 из Приморского края и 1 из Хабаровского края. В ходе полевых экспериментов 2023 года проводились фенологические наблюдения за ростом и развитием растений, а также оценка хозяйственно ценных признаков на базе лаборатории селекции и первичного семеноводства (с. Садовое Тамбовского района). Проводили стандартную ПЦР на готовой реакционной смеси с использованием 20 пар праймеров. В ходе анализа простых последовательных повторов (SSR) установлены 11 маркеров, ассоциированных с локусами количественных признаков (QTLs), такими как вегетационный период, масса семян, содержание белка и масла в семенах сои. Корреляционный анализ проводили с помощью коэффициента взаимной сопряженности Пирсона. Результаты показали существование прямой умеренной связи между массой 1000 семян и локусом Satt517 (rxy=0,39). В то же время, установлена обратная зависимость между массой семян и локусом Satt005 (rxy=-0,34), что подчеркивает его влияние на снижение этого показателя. Анализ содержания белка в семенах выявил умеренную корреляцию с локусом Satt431 (rxy=0,32). Что касается содержания масла, только Satt005 проявил обратную умеренную связь (rxy=-0,34). Другие локусы, такие как Satt002, Satt173, Satt234, Satt281, Satt373, Satt442, Satt556 и Satt565, продемонстрировали слабую корреляцию с хозяйственно-ценными признаками, что может ограничивать их использование в селекции сои. Микросателлиты представляют собой важный инструмент для изучения генетических свойств организмов, поскольку они могут выступать маркерами определённых фенотипических проявлений. Тем не менее, на сегодняшний день влияние этих маркеров на продуктивные качества ещё не установлено. Результаты текущего исследования, проведённого на ограниченной выборке и с использованием небольшого числа маркеров, требуют дальнейшей проверки. Для получения более точных и обширных данных необходимо провести масштабные исследования, такие как картирование связей или анализ больших популяций. Это позволит глубже понять роль микросателлитов в фенотипическом разнообразии.
Литература
Hu Z, Zhang D, Zhang G, Kan G, Hong D, Yu D. Association mapping of yield-related traits and SSR markers in wild soybean (Glycine soja Sieb. and Zucc.) // Breed Sci. – 2014. – №63(5). – P. 441-449. –doi: https://doi.org/10.1270/jsbbs.63.441.
Maeda R.K, Karch F. Gene expression in time and space: additive vs hierarchical organization of cis-regulatory regions // Curr Opin Genet Dev. – 2011. – №21. – P.187-193.
Perenthaler, E., Yousefi, S., Niggl, E., & Barakat, T. S. Beyond the exome: the non-coding genome and enhancers in neurodevelopmental disorders and malformations of cortical development // Frontiers in cellular neuroscience. – 2019. – Vol.13(352). – P. 1-20. https://doi.org/10.3389/fncel.2019.00352/
Zhuang Y, Li X, Hu J, Xu R, Zhang D. Expanding the gene pool for soybean improvement with its wild relatives // aBIOTECH. – 2022. – №3(2). – P. 115-125. https://doi.org/10.1007/s42994-022-00072-7.
Бондаренко О.Н. К вопросу о микросателлитных ассоциациях культурной сои Амурской области с сельскохозяйственными признаками / О.Н. Бондаренко, П.Д. Тимкин, Л.Е. Иваченко, А.А. Блинова, А.А. Пензин // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. – 2023. – Т. 13, № 3(46). – С. 425-433. https://doi.org/10.21285/2227-2925-2023-13-3-425-433.
Бондаренко О.Н. Комбинированный метод оптимизации условий ПЦР для скрининга дикой сои / О.Н. Бондаренко, С.И. Лаврентьева // Пермский аграрный вестник. – 2023. – № 4(44). – С. 34-43. https://doi.org/10.47737/2307-2873_2023_44_34
Галиченко А.П. Оценка генофонда коллекционных форм Glycine soja по хозяйственно ценным признакам / А.П. Галиченко, О.Н. Бондаренко, А.А. Блинова // Пермский аграрный вестник. – 2024. – № 2(46). – С. 38-44. https://doi.org/10.47737/2307-2873_2024_46_38
Пензин А.А. Корреляционный анализ длин микросателлитных локусов с хозяйственно ценными признаками диких форм сои / А.А. Пензин, П.Д. Тимкин // Биотехнология: взгляд в будущее: Материалы IX Международной научно-практической конференции, Ставрополь, 30 марта 2023 года. – Ставрополь: Изд-во СтГМУ, 2023. – С. 80-82.
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.