Исследование геномной конституции некоторых видов рода Deschampsia P. Beauv. (Aveneae Dumort., Poaceae)
УДК 582.542.1:575.17
Аннотация
Для 7 видов рода Deschampsia разного географического происхождения и Avenella flexuosa было проведено локус-специфичное секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности района внутреннего транскрибируемого спейсера ITS1 и начала гена 5.8S рРНК. Показано, что виды родственные D. cespitosa формируют общую сеть риботипов, при этом D. pamirica, северные и субантарктические образцы Deschampsia обладают собственными уникальными группами риботипов. Выявлено, что риботипы A. flexuosa занимают обособленное положение и мало связаны с родственными видами Deschampsia.
Скачивания
Metrics
Литература
Камелин Р. В. Декции по систематике растений. Главы теоретической систематики растений. - Барнаул: Издательство «Азбука», 2004. - 228 с.
Камелин Р. В. Особенности видообразования у цветковых растений // Труды Зоологического института РАН, 2009. - Приложение № 1. - С. 141-149.
Родионов А. В., Гнутиков A. А., Коцинян А. Р., Коцеруба В. В., Носов Н. Н., Пунина Е. О., Райко М. П., Тюпа Н. Б., КимЕ. С. Последовательность ITS1-5.8S рДНК-ITS2 в генах 35S рРНК как маркер при реконструкции филогении злаков (сем. Poaceae) // Утехи современной биологии, 2016. - Т. 136, № 5. - С. 419-438.
Цвелев Н. Н., Пробатова Н. С. Злаки России. - СПб-Владивосток: Товарищество научных изданий КМК, 2019. - 646 с.
Amosova A. V., Bolsheva N. L., Zoshchuk S. A., Twardovska M. O., Yurkevich O. Yu., Andreev I. O., Samatadze T. E., Badaeva E. D., Kunakh V. A., Muravenko O. V. Comparative molecular cytogenetic characterization of seven Deschampsia (Poaceae) species // PLoS ONE, 2017. - Vol. 12(4). - e0175760. DOI: 10.1371/journal.pone.0175760
Chiapella J. A molecular phylogenetic study of Deschampsia (Poaceae: Aveneae) inferred from nuclear ITS and plastid trnL sequence data: Support for the recognition of Avenella and Vahlodea // Taxon, 2007. - Vol. 56(1). - P. 55-64. DOI: 10.2307/25065735
Clement M., Posada D., Crandall K. A. TCS: a computer program to estimate gene genealogies // Molecular Ecology, 2000. - Vol. 9, No 10. - P. 1657-1660. DOI: 10.1046/j.1365-294x.2000.01020.x
Gnutikov A. A., Myakoshina Ju. A., Nosov N. N., Punina E. O., Rodionov A. V. IAPT chromosome data 32/5 (K. Mar-hold & J. Kucera (eds.), & al.) // Taxon, 2020. - Vol. 69, No 5. - P. 1128-1129. E9-E10. DOI:10.1002/tax.12322
Krahulcova A. Chromosome numbers in selected monocotyledons (Czech Republic, Hungary, and Slovakia) // Preslia, 2003. - Vol. 75. - P. 97-113.
Murias dos Santos A., Cabezas M. P., Tavares A. I., Xavier R., Branco M. TCS BU: A tool to extend TCS network layout and visualization // Bioinformatics, 2016. - Vol. 32, No 4. - P. 627-628. D0I:10.1093/bioinformatics/btv636
Quintanar A., Castroviejo S., Catalan P. Phylogeny of tribe Aveneae (Pooideae, Poaceae) inferred from plastid trnT-F and nuclear ITS sequences // American Journal of Botany, 2007. - Vol. 94. - P. 1554-1569.
Rodionov A. V., Nosov N. N., Kim E. S., Machs E. M., Punina E. O., Probatova N. S. The origin of polyploid genomes of bluegrasses Poa L. and gene flow between northern Pacific and Sub-Antarctic islands // Russian Journal of Genetics, 2010. - Vol. 46, No 12. - P. 1407-1416. DOI: 10.1134/S1022795410120021
Soreng R. J., Peterson P. M., Romaschenko K., Davidse G., Zuloaga F. O., Judziewicz E. J., Filgueiras T. S., Davis J. I., Morrone O. A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) // J. Syst. Evol. 2015. -Vol. 53. - P. 117-137.
