Молекулярно-генетическое исследование видов р. Trollius L. с использованием ISSR, ITS, rbcL и matK маркеров
УДК 582.675.1*575.113
Аннотация
Trollius L. – род растений из семейства Ranunculaceae Juss., имеющих декоративное и прикладноезначение. На территории Сибири отмечается наибольшее разнообразие представителей данного рода. В ходеисследования был проведён популяционно-генетический анализ 7 популяций Trollius asiaticus, 2 популяций T. vitalii и 1 популяции T. sibiricus, произрастающих на юге Сибири с использованием ISSR-PCR маркеров. Выявлено 114 локусов, суммарный полиморфизм которых составляет 98,25 %. Число амплифицированных фрагментовв зависимости от праймера варьирует от 27 (17899A) до 32 (ISSR-17 и HB14). Коэффициент подразделённостипопуляций (GST) составляет 0,5186, следовательно, изученные популяции имеют высокую степень дифференциациипо классификации Райта и разделяются на отдельные виды. На дендрограмме сходства популяций выделяется2 кластера, один из которых формируют популяции, относящиеся к виду T. sibiricus. Во второй кластер входятпопуляции T. asiaticus и T. vitalii. Обособленную группу, предположительно относящуюся к новому виду T. austrosibiricus Erst et Luferov, образуют байкальская и иджимская популяции. При построении дерева по отдельнымпредставителям наблюдается четкое разделение популяций на обособленные группы. При проведении филогенетического анализа по нуклеотидным последовательностям ITS регионов, хлоропластных генов matK и rbcL быловыявлено отсутствие значимых различий между видами T. asiaticus, T. vitalii, T. kolonok, T. europaeus L., T. altaicusи T. sibiricus. Единичные однонуклеотидные замены отмечены в последовательностях matK у T. europaeus, T. altaicus и T. kolonok.
Скачивания
Metrics
Литература
Степанов Н. В. Новый вид Trollius L. (Ranunculaceae) из Кузнецкого Алатау // Систематические заметки по материалам гербария им. П. Н. Крылова Томского государственного университета, 2018. – №. 117. – С. 40–45.
Степанов Н. В. Флорогенетический анализ (на примере северо-восточной части Западного Саяна): Учебное пособие. Часть 1 / Н. В. Степанов. – Красноярск: Краснояр. гос. ун-т., 1994. – 108 с.
Фризен Н. В. Trollius L. – Жарок, или купальница // Флора Сибири. В 14 т. T.6. – Новосибирск, 1993. – С. 103– 108.
Doroszewska A. The genus Trollius L. / A taxonomical study. Monogr. bot., 1974. – P. 1–184.
Doyle J. J., Doyle J. L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochemical bulletin, 1987. – Vol. 19. – №. 1. – P. 11–15.
Erst A., Luferov A., Troshkina V., Shaulo D., Kuznetsov A., Xiang. K., Wang W.Trollius austrosibiricus (Ranunculaceae), a new species from South Siberia // PhytoKeys, 2019. – №. 115. – С. 83.
Erst A. S., Luferov A. N., Troschkina V. I., Xiang K., Wang W. The genus Trollius L. (Ranunculaceae) in the flora of the Altai Mountain Country // Систематические заметки по материалам Гербария им. П. Н. Крылова Томского государственного университета, 2018. – №118. – P. 64–67.
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms //Molecular biology and evolution, 2018. – Vol. 35. – №. 6. – P. 1547–1549.
Luferov A. N., Erst A. S., Luferov D. N., Shmakov A. I., Wang W. The genus Trollius (Ranunculaceae) in the Russian Far East // Turczaninowia, 2018. – 21(2). – P 110–116. DOI: 10.14258/turczaninowia.21.2.12
National Center for Biotechnology Information Search database. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Serebryanyi M. M. Towards a taxonomic revision of the genus Trollius (Ranunculaceae) in the Asian part of Russia. I. Trollius chinensis: taxonomic and geographical reconsiderations // Novitates Systematicae Plantarium Vascularium, 2019. – Vol. 50. – P. 101–114. DOI: 10.31111/novitates/2019.50.101
Tavaré S. Some probabilistic and statistical problems in the analysis of DNA sequences // Lectures on mathematics in the life sciences, 1986. – Vol. 17. – №. 2. – P. 57–86.
