РИБОСОМ-ИНАКТИВИРУЮЩИЕ БЕЛКИ (RIPS) БУЗИНЫ ЧЕРНОЙ SAMBUCUS NIGRA

УДК 547.963.32:577.112.083

  • Хилола Тожимуродовна Агзамхужаева Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз Email: micom.uz@gmail.com
  • Юлия Игоревна Ощепкова Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз Email: joshepkova05@rambler.ru
  • Шавкат Исмаилович Салихов Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз Email: joshepkova05@rambler.ru
Ключевые слова: Sambucus nigra, кора, ягоды, рибосом-инактивирующие белки, масс-спектр, De novo секвенирование

Аннотация

Цель данной работы – изучение состава рибосом-инактивирующих белков из коры и ягод бузины черной Sambucus nigra L., произрастающей на территории Республики Узбекистан.

Исследован состав рибосом-инактивирующих белков в коре и ягодах бузины черной Sambucus nigra L., собранной в Ботаническом саду Республики Узбекистан. По данным ВЭЖХ-МС/МС секвенирования, в образце из коры установлено наличие 9-и RIP-2. На основе полученных аминокислотных последовательностей с применением программы CLUSTAL O (1.2.4) проведено сравнение аминокислотной последовательности идентифицированных RIP типа 2 и определены сходные и консервативные остатки, которые в дальнейшем помогут идентифицировать новые RIP. В ходе выполнения исследований с высокой долей вероятности идентифицирован триптический-пептид LSLVVLQMVSEAAR, содержащий мотив активного центра RIP (EAAR). Масс-спектральные данные по этому фрагменту позволят в дальнейшем проводить идентификацию других RIP-1/2 из других образцов природного происхождения.

Из ягод выделено 2 RIP, один из которых находится в восстановленной форме, содержащей одну цепь. При установлении аминокислотной последовательности в выделенном RIP из ягод бузины черной с молекулярной массой 62 337 Да подтверждена наша гипотеза об идентифицикации по триптическому пептиду, содержащему активный центр RIP (EAAR).

Скачивания

Данные скачивания пока недоступны.

Metrics

Загрузка метрик ...

Биографии авторов

Хилола Тожимуродовна Агзамхужаева, Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз

младший научный сотрудник лаборатории химии белков и пептидов

Юлия Игоревна Ощепкова, Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз

доктор химических наук, профессор, заместитель директора

Шавкат Исмаилович Салихов, Институт биоорганической химии им. акад. А.С. Садыкова АН РУз

заведующий лабораторией химии белков и пептидов, академик

Литература

Peumans W.J., Hao Q., Van Damme E.J.M. FASEB J., 2001, vol. 15, pр. 1493–1506.

Stirpe F., Battelli M.G. Cell. Mol. Life Sci., 2006, vol. 63, pр. 1850–1866.

Van Damme E.J.M., Hao Q., Barre A., Vandenbussche F., Desmyter S., Rougé P. et al. Crit. Rev. Plant Sci., 2001, vol. 20, pр. 395–465.

Stirpe F., Barbieri L. FEBS Lett., 1986, vol. 195, pр. 1–8. DOI: 10.1016/0014-5793(86)80118-1.

Kwon S.Y., An C.S., Liu J.R., Kwak S-S., Lee H.S., Lim J.K., Paek K.H. Mol. Cells, 2000, vol. 10, pр. 8–12. DOI: 10.1007/s10059-000-0008-6.

de Benito F.M., Citores L., Iglesias R., Ferreras J.M., Soriano F., Arias J., Mendez E., Girbes T. FEBS Lett., 1995, vol. 360, pp. 299–302. DOI: 10.1016/0014-5793(95)00130-2.

de Benito F.M., Iglesias R., Ferreras J.M., Citores L., Camafeita E., Mendez E., Girbes T. FEBS Lett., 1998, vol. 428, pp. 75–79. DOI: 10.1016/S0014-5793(98)00496-7.

Rojo M.A., Yato M., Ishii-Minami N., Minami E., Kaku H., Citores L., Girbes T., Shibuya N. Arch. Biochem. Bio-phys, 1997, vol. 340, pp. 185–194. DOI: 10.1006/abbi.1997.9927.

van Damme E.J., Barre A., Rouge P., Van L.F., Peumans W.J. Eur. J. Biochem., 1996, vol. 237, pp. 505–513.

Pascal J.M., Day P.J., Monzingo A.F., Ernst S.R., Robertus J.D., Iglesias R., Perez Y., Ferreras J.M., Citores L., Girbes T. Proteins, 2001, vol. 43, pp. 319–326. DOI: 10.1002/prot.1043.

Girbes T., Citores L., Iglesias R., Ferreras J.M., Munoz R., Rojo M.A., Arias F.J., Garcia J.R., Mendez E., Calonge M. J. Biol. Chem., 1993, vol. 268, pp. 18195–18199.

Citores L., de Benito F.M., Iglesias R., Ferreras J.M., Argueso P., Jimenez P., Testera A., Camafeita E., Mendez E., Girbes T. Cell. Mol. Biol., 1997, vol. 43, pp. 485–499.

Citores L., de Benito F.M., Iglesias R., Miguel F.J., Argueso P., Jimenez P., Mendez E., Girbes T. Planta, 1998, vol. 204, pp. 310–319. DOI: 10.1007/s004250050261.

Girbes T., Citores L., Ferreras J.M., Rojo M.A., Iglesias R., Munoz R., Arias F.J., Calonge M., Garcia J.R., Men-dez E. Plant Mol. Biol., 1993, vol. 22, pp. 1181–1186. DOI: 10.1007/BF00028990.

de Benito F.M., Citores L., Iglesias R., Ferreras J.M., Camafeita E., Mendez E., Girbes T. FEBS Lett., 1997, vol. 413, pp. 85–91. DOI: 10.1016/S0014-5793(97)00882-X.

van Damme E.J., Barre A., Rouge P., Van L.F., Peumans W.J. J. Biol. Chem., 1997, vol. 272, pp. 8353–8360.

van Damme E.J., Roy S., Barre A., Citores L., Mostafapous K., Rouge P., Van L.F., Girbes T., Goldstein I.J., Peu-mans W.J. Eur. J. Biochem., 1997, vol. 245, pp. 648–655.

Ferreras J.M., Citores L., Iglesias R., Jiménez P., Girbés T. Toxic Plant Proteins, Plant Cell Monographs. Springer-Verlag; Berlin, Germany, 2010, vol. 18, pp. 107–131.

Citores L., deBenito F.M., Iglesias R., Ferreras J.M., Jimenez P., Argueso P., Farias G., Mendez E., Girbes T. J. Exp. Bot., 1996, vol. 47, pp. 1577–1585. DOI: 10.1093/jxb/47.10.1577.

Girbes T., Citores L., de Benito F.M., Inglesias R., Ferreras J.M. Biochem. J., 1996, vol. 315, p. 343.

Citores L., Iglesias R., Munoz R., Ferreras J.M., Jimenez P., Girbes T. J. Exp. Bot., 1994, vol. 45, pp. 513–516. DOI: 10.1093/jxb/45.4.513.

Rojo M.A., Citores L., Jimenez P., Ferreras J.M., Arias F.J., Mendez E., Girbes T. Protein Pept. Lett., 2003, vol. 10, pp. 287–293. DOI: 10.2174/0929866033478979.

Laemmli U.K. Nature, 1970, vol. 227, pp. 680–685.

Girbés T., Citores L., Ferreras J.M., Rojo M.A., Iglesias R., Muñoz R., Arias F.J., Calonge M., Garcı́a J.R., Méndez E. Plant Mol. Biol., 1993, vol. 22, pp. 1181–1186.

Van Damme E.J.M., Barre A., Rougé P., Van Leuven F., Peumans W.J. Eur. J. Biochem., 1996, vol. 235, pp. 128–137.

Опубликован
2023-10-02
Как цитировать
1. Агзамхужаева Х. Т., Ощепкова Ю. И., Салихов Ш. И. РИБОСОМ-ИНАКТИВИРУЮЩИЕ БЕЛКИ (RIPS) БУЗИНЫ ЧЕРНОЙ SAMBUCUS NIGRA // Химия растительного сырья, 2023. № 3. С. 117-125. URL: http://journal.asu.ru/cw/article/view/11724.
Выпуск
Раздел
Биополимеры растений